東京大学大学院新領域創成科学研究科の吉田 悠大学院生、富永 賢人特任研究員、吉澤 晋准教授、同大学大気海洋研究所の伊藤 萌特任研究員、海洋研究開発機構の西村 陽介研究員、東北大学・海洋研究開発機構変動海洋エコシステム高等研究所の長谷川 万純ポストドクトラル研究員、目黒寄生虫館の髙野 剛史研究員、沖縄科学技術大学院大学の和田 直久スタッフサイエンティスト、国立科学博物館の小川 晟人特定非常勤研究員、九州大学の後藤 恭宏助教（研究当時）、林 哲也教授（研究当時）、東京科学大学の伊藤 武彦教授らの研究グループは、深海に生息するセンジュナマコ類（Scotoplanes）の体壁（注1）に優占する未知の共生細菌を発見し、そのゲノム（注2）の特徴と宿主組織内での分布を明らかにしました。

本研究では、東北海洋生態系調査研究船「新青丸」と学術研究船「白鳳丸」を用いて北西太平洋の北日本沖で採集したセンジュナマコ類3種5個体を対象に、DNA解析とFISH法（注3）を組み合わせ、体壁に生息する細菌を調べました。その結果、新属新種候補（注4）の細菌が体壁細菌叢（注5）の大部分を占めることが分かりました。また、蛍光顕微鏡観察により、この細菌が体壁の外側に近い組織内に集まって存在することを確認しました。さらに、この細菌は約65万塩基対の小さなゲノム（大腸菌の約7分の1）を持ち、解糖系（注6）をはじめとする多くの代謝経路に必要な遺伝子を欠く一方で、細胞表面に存在すると予測される機能未知のタンパク質の遺伝子群が、ゲノム全体の4分の1以上を占めることが明らかになりました。

本研究の成果は、センジュナマコをはじめとする深海底で優占する棘皮動物（注7）の体壁で特定の細菌が優占する仕組みや、深海における宿主と細菌の共生関係を理解するための新たな手掛かりとなることが期待されます。